Installazione hard disk con file system NTFS

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Buongiorno a tutti,
ho deciso di sostituire il mio server Windows 2003 con un meno esoso di corrente e meno rumoroso NAS Synology DS210j, visto che per lo più utilizzo questo server come file server.
Nel server ho due dischi formattati ovviamente con NTFS, ho letto che il nas utilizza solo EXT3 come file system per i dischi interni. Per ora sto copiando in un hard disk esterno tutti i dati di questi due dischi ma mi chiedevo se c'è la possibilità di convertire il file system da NTFS a EXT3 senza dover poi ricopiare tutto, visto che ci vuole più di un giorno, direttamente dal nas. Grazie ed un saluto.